Wdrożenie wymagań AEO przez konsultantów DGA polega na poprowadzeniu klienta przez wszystkie wymagane etapy wdrożenia definiowane w dokumentacji Służby Celnej RP.

Pierwszym krokiem będzie przeprowadzenie audytu wstępnego. Dla każdej z wybranych komórek organizacyjnych zostanie ustalony zakres przeprowadzonego audytu. Zakłada się, iż podczas audytu spełnienia wymagań AEO zostaną zweryfikowane obszary o których mowa w wytycznych oceny dotyczących AEO obowiązujących w Polsce. Na podstawie danych uzyskanych podczas audytu konsultanci opracują wynik, obrazujący aktualnie realizowany stopień spełnienia w stosunku do dokumentu odniesienia, dla każdego ze zdiagnozowanych obszarów AEO. Raport zawierał będzie wskazanie spełnionych i niespełnionych przedmiotowych wytycznych AEO oraz wskazanie potencjalnych działań, jakie należy zapewnić, aby zagwarantować spełnienie wszystkich wymagań.

Kolejnym etapem będzie przeprowadzenie analizy ryzyka w odniesieniu do zagrożeń wynikających z AEO. Analiza ryzyka jest kluczowym elementem doskonalenia systemu zarządzania AEO. Jest to także element, który często sprawia największe problemy przy wdrożeniu wytycznych AEO – osoby odpowiedzialne za przeprowadzenie analizy mają trudności z wiarygodnym identyfikowaniem zagrożeń, czy oceną prawdopodobieństwa ich spełnienia. Problemem jest także odpowiednie oddanie skutku utraty informacji i jego wpływu na wynikowe ryzyko.

Przeprowadzenie analizy ryzyka determinuje potrzebę wskazania ryzyk, które będą musiały być minimalizowane w cyklu doskonalenia systemu zarządzania AEO. Wskazanie zarówno ryzyk nieakceptowanych, jak i tych, które są możliwe do zaakceptowania przez najwyższe kierownictwo jest wymagane do dalszego prowadzenia projektu. Potrzebne jest to do opracowania planu postępowania z ryzykiem.

Ostatnim etapem wdrożenia jest opracowanie niezbędnej dokumentacji – zgodnie z wynikami analizy ryzyka. Niniejszy etap projektu związany jest z opracowaniem najważniejszych dokumentów związanych z spełnieniem wymagań AEO oraz ich ciągłym doskonaleniu. Związane jest to z utworzeniem lub modyfikacją zbioru procedur/instrukcji związanych z kluczowymi obszarami funkcjonowania firmy. W szczególności będą to:

• Procedury przepływu towarów
• Procedury celne 
• Procedury bezpieczeństwa zasobów informacyjnych 
• Procedury bezpieczeństwa fizycznego